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屠苏与晴雪登上向天笑兄弟俩的机关飞船“沦波舟”，飞越淼淼汪洋，不料在半途遇到雷云之海，晴雪被风暴卷出船外，屠苏拼命拉住她，最终二人一同坠入雷云之中。雷云内部并没有风暴，是一片死寂的废墟，依稀可辨城门上的蓬莱二字。这片废墟被雷云包围，地脉之气无法流出，因此幻境中还保留着多年前的景象。屠苏与晴雪一路走来，看到蓬莱公主巽芳与欧阳少恭两情缱绻，看到少恭出海寻医，蓬莱突降天灾，巽芳为了抵抗天灾身受重伤。两人正在感慨，雷云之海突然打开了一条缝隙，屠苏借助煞气带晴雪飞出了雷云之海，两人降落在榣山上。另一边，尹千觞在青玉坛发现有弟子身上长出梦魂枝，生死未卜。在这个弟子面前是一个密室，令千觞想起少恭曾在密室里进行各种恐怖的实验，其中就包括梦魂枝，没想到这个密室还保留在青玉坛中。
元勿向少恭请示是否给求药的人赐药，少恭明知丹药有毒，却仍送出丹药，让那些贪婪的求药者自尝恶果。千觞觉得少恭变了，少恭却岔开话题，让他去找青玉坛弟子打听瑾娘下落。千觞逼问元勿，终于知道假巽芳就是瑾娘。另一边，屠苏和晴雪在榣山中行走，屠苏觉得这个地方很熟悉，自己曾经梦到过很多次，梦中一人在弹琴，一条蛇游上岸来，化作人形倾听。晴雪摘下悬崖上的月灵花，突然从悬崖下的海水里冒出一条黑龙，二话不说就打昏了晴雪。屠苏拦下黑龙的攻击，黑龙化为人形，竟然是屠苏梦里出现过的悭臾——那条化为人形听琴的蛇。悭臾对屠苏讲述他和太子长琴的往事，屠苏终于明白自己身上有太子长琴的一半仙灵。悭臾还告诉屠苏，如果解开他身上的煞气封印，就可以获得太古仙人的强大力量，但凡人是无法承受这力量的，解开封印三天后就会魂飞魄散，湮灭于天地之间。悭臾提出想再听一次长琴的琴曲，屠苏以吹叶代替，悭臾又提出让屠苏坐在他龙角旁，实现当初带长琴看尽山河风光的约定，屠苏却说自己不是长琴，拒绝了邀约。悭臾送给屠苏一枚鳞片，让他想通后召唤自己。
屠苏与晴雪走出榣山，与向天笑兄弟会合，回到了同城。青玉坛内，千觞告诉少恭巽芳是瑾娘易容所扮，少恭不信，千觞要去找元勿对质，却发现元勿已被灭口，少恭一脸平静。千觞终于明白这一切都是少恭所为，假巽芳的事他也早就知道，是故意留着她向雷严传递他想传出去的消息。千觞要少恭交出瑾娘，少恭却说她还有用，二人交手，千觞不敌，少恭留他一命，劝他离开从此不再相见。另一边，兰生跟着襄铃回红叶湖找父母，路上遇到了善良的女大夫姜离和狐族首领襄墨阳。襄墨阳为了保护姜离与狐族叛徒激战，襄铃兰生也来相助。襄墨阳和姜离认出襄铃就是他们的女儿，却没有相认，只送给她一个随时可以召唤襄墨阳的狐牙项链。
屠苏和晴雪带着月灵花来青玉坛找少恭，少恭开炉炼丹。期间屠苏和少恭谈心，少恭对魂魄分离之事深表遗憾。天墉城内，陵端自知打不过屠苏，为了除掉屠苏不惜用禁妖洞内的妖怪附体到自己身上，芙蕖偶然间发现此事，却被陵端打昏。掌教得知芙蕖受伤大怒，陵端谎称是鬼面人同党所为，掌教便派他下山追查，正中陵端下怀，他以妖力控制了一众师弟，带着他们一起去追杀屠苏。与此同时，少恭炼成了起死回生的丹药，叮嘱屠苏复活之人不能照射阳光。屠苏、晴雪、陵越一起前往乌蒙灵谷，正好遇上了兰生和襄铃。兰生与陵越终于兄弟相认，屠苏也鼓起勇气拿上丹药去复活母亲。
屠苏喂韩休宁服下丹药，韩休宁果然复活，却不言不语，让众人十分担心。襄铃带着兰生去找抚养自己长大的树爷爷，树爷爷嘱咐兰生要照顾好襄铃。青玉坛中，千觞再度来找瑾娘，正遇上假巽芳，两人一番激战，假巽芳露出了青玉坛的武功招式，眼看无法抵赖，千觞突然头疼发作，假巽芳趁机逃跑。少恭告诉假巽芳，他已经练成长生不老的丹药，假巽芳开心地服下，却立刻不能动弹，脸也变回了素锦。少恭遗憾地说，原以为可以保留巽芳的容貌，不然也不需要留你到现在，素锦这才知道少恭早就计划好一切，却已经无力回天，只能静待死亡。乌蒙灵谷里，屠苏不眠不休地照顾母亲，终于累极睡去，韩休宁趁他不备，迎着初升的日光走出了房门。屠苏追出门外，飞扑到她身上想要遮住阳光，却只来得及看到韩休宁在他怀中化为无数萤光飞散。
晴雪询问幽都婆婆，得知韩休宁并没有真正复活，那是千万只名为焦冥的小虫，它们吃掉了原本的尸身，又按照宿主的形貌凝聚成一个无悲无喜的偶人。焦冥不惧刀剑水火，只有蕴含灵力的火焰才能烧毁。屠苏得知母亲尸骨无存，正在悲痛，陵端出现在红叶湖，烧伤树爷爷，劫持了襄铃和兰生，来到乌蒙灵谷中威胁屠苏。屠苏本就悲愤，一激之下煞气爆发，打败了妖化的陵端，杀意仍未平息，竟向兰生襄铃挥剑。晴雪双手握住剑刃，唤回屠苏神智。紫胤真人赶到，封住煞气，废去陵端修为，将他逐出天墉城。屠苏向师尊表明不回天墉城的决心，紫胤也不勉强，留下几卷心法后和陵越一起离去了。到了晚上，焦冥重新汇聚为人形，屠苏忍住悲痛亲手焚烧了母亲的人偶，与晴雪约定要一起去更多的地方、帮助更多的人。